保山中医药高等专科学校中医药系成立于2007年7月，是由原保山卫生学校中医科发展而来，已有41年中医教育的历史。现有中医学、针灸推拿、中药学及中医骨伤4个专业招生。有专职教师37人，教授2人，副教授6人，中级职称13人，硕士研究生学历教师16人，其中“双师型”教师32人。近三年来主持国家中医药管理局“十二五”中医药教育教学改革研究课题2项，省级科研课题7项，市级科研课题2项。主编云南省“十二五”规划教材3部，省级精品教材1部——《中药炮制技术》，参编教材8部 撰写专著4部。现有省级教学名师2人，省级特色专业2个（针灸推拿专业、中药专业），省级精品课程2门——《方剂学》、《推拿手法学》，省级教学团队一个——针灸推拿教学团队，获云南省高等教育教学成果一等奖1项，云南省高等教育学会第八次优秀高教科研成果二等奖1项，保山市科技进步三等奖1项。一人获云南省推拿技术能手称号。拥有云南省一流的中药标本馆、针推实训中心、高黎贡山民族医药陈列馆、中医综合实训室，学生实训场所面积达2000多平方米，完全能满足在校学生实践教学的需要。历年来，为社会培养了大批的基础理论扎实、临床技能过硬的中医药人才，得到了社会和用人单位的认可，毕业生深受各级医药单位的欢迎。
1、中医学专业
培养目标：培养具有中医理、法、方、药等基本理论和技能，能熟练、准确运用中医理论对临床常见病、多发病、地方病进行独立诊疗的实用型高级专业技术人才。
毕业去向：
专科学生：各级医疗部门从事医疗、预防、卫生保健等工作，成绩优秀的学生可通过考试升入本科继续学习。
中专学生：毕业所取得学历，可作为参加中医类别医师资格考试的学历依据。中等中医类专业毕业生考取执业助理医师资格后，主要面向乡镇卫生院、村卫生室等基层医疗机构执业。
2、针灸推拿专业
培养目标：培养具有针灸推拿行业所必需的理论知识和操作技能，具有中医学和现代医学基本理论和基本技能，具有从事本专业工作的综合职业能力和全面素质，适应社会经济发展需要，适应医疗保健针灸推拿职业岗位工作需要的德、智、体、美全面发展的高素质技能型针灸推拿人才。
毕业去向：本专业毕业生为短缺人才，其就业前景极其广阔，主要到各级医院的中医、针灸、推拿、理疗、康复、美容、保健等科室从事医疗工作；也可到各类康复、保健、养生、美容等机构从事养生保健工作；也适宜学生个人自主创业；本专业只要学生愿意学校保证推荐就业。我校针灸推拿专业属云南省省级特色专业，毕业后可以参加相关执业医师考试，可通过考试升入本科继续学习。
3、中药专业
培养目标：培养具备中药学基础理论、基本知识、基本技能以及与其相关的中医学、药学等方面的知识和能力，具有从事本专业实际工作的综合职业能力和全面素质，能在中药生产、检验、流通、使用、研究开发、管理和服务等领域从事中药鉴定、营销、制剂及临床合理用药等方面工作的高素质技能型中药人才。
毕业去向：在各类型综合性医疗单位及制药厂从事中药生产、鉴定、制剂、检测、研发工作，也可在医药公司、药店从事药品管理、营销工作，更适应学生个人自主创业。
4、中医骨伤专业
培养目标：培养具备中医骨伤科基本理论和操作技能、中医药基础知识、现代医学知识，能运用中西医治疗技术处理骨伤科常见病、多发病的应用型高级专业技术人才。
毕业去向：城镇医院、乡镇卫生院、城市社区卫生服务中心等基层医疗单位从事中医骨伤诊疗工作，或在医学院校、医学科研单位及其它医疗机构从事技术辅助工作的中医骨伤专业技术人才。成绩优秀的学生可通过考试升入本科继续学习。