云南中医学院创建于1960年，是全国第二批成立的高等中医药本科院校。1986年获准为硕士学位授权单位，2009年列为云南省省级立项建设博士授予单位。
学校坚持以中国特色社会主义理论体系为指导，全面贯彻党的教育方针，坚持立德树人、促进学生全面发展、终身发展的教育理念，以中医药为主体，积极发展民族医药，引领云南中医药发展，服务国家和云南健康事业与产业发展，造福人类健康。
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学校不断推进国际交流与合作，招收美国、澳大利亚、日本、泰国、越南等10余个国家和港澳台地区学生。与西班牙、澳大利亚、泰国、越南等国家和地区的25所大学、医疗和科研机构建立了合作关系，开展教学、医疗和科研的交流与合作。是云南省第一家在境外开展专业教育的高校。
在50多年办学历程中，学校秉承“崇德和合、博学敦行”的校训，以服务地方经济社会发展为己任，人才培养成效显著，师资结构持续优化，办学特色日益凸显，科研实力明显增强，产学研结合特色鲜明，办学影响力显著提高，综合办学实力不断增强，正向着区域有影响力的高水平中医药院校目标迈进。
