信息安全系是学院为适应信息安全发展需要、突出学院特色而新开办的一个系，将为国家培养具有密码特色、从事信息安全领域研究、管理与应用开发的高素质人才。信息安全系主要承担全院密码、信息安全课程的教学工作，并承担全院密码学科的建设工作。
设有密码教研室，信息安全教研室，信息安全实验室和密码应用教学基地，根据科研工作的需要，分别设立了密码理论与应用技术研究室，信息安全技术研究室和信息隐藏技术研究室。全系拥有教师 24名。其中，教授4 人，副教授2 人，高级工程师1人，主任科员1人，讲师 13人，助教 3人;青年教师均具有硕士以上学历，5人具有博士学历。1人获得国务院颁发的政府特殊津贴，2人荣立全国党政密码系统一等功，4人被西安电子科技大学遴选为硕士研究生合作导师。