新疆财经大学商务学院电子商务培养目标：面向西部经济发展需要，尤其是网络经济发展需要，具备经济学、管理学理论基础和扎实的计算机科学技术知识及应用能力，掌握现代通信与网络技术和网络营销策略;掌握电子商务运作和各环节管理、电子商务政策法规等方面的知识，具有使用现代信息技术开展商务活动的能力，能在新疆工商企业、经济管理部门、金融机构从事电子商务运作与管理，进行电子商务系统设计与评价的复合型专门人才。
新疆财经大学商务学院电子商务主要课程：电子商务技术基础、电子商务数据库技术、电子商务网络技术、国际贸易理论与实务、网络数据库、电子商务网页设计与制作、电子商务网站设计与管理、网上支付与结算、物流与供应链管理、第三方物流、市场调查与预测、网络营销学、人力资源管理、创业管理等。