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截至2016年6月，学校承担国家级科研项目12项，其中国家自然科学基金项目4项，国家社科基金项目2项,国家星火计划项目6项，省部级立项课题218项，其中省自然科学基金项目39项，省科技厅资助的重大科技专项项目3项、其它省科技计划项目98项;获国家教学成果二等奖5项，省教学成果一等奖4项、二等奖6项，全国教育科学研究优秀成果二等奖1项，省科学技术二、三等奖各1项，省哲学社会科学优秀成果奖二、三等奖和优秀奖各1项，市级以上科研成果奖30 0余项;获授权专利508件;获软件著作权81件;年科技服务到款超千万元，年社会培训16万余人天。
2016年，《中国高教研究》发布《2015年全国高校高等教育科研论文统计分析》，金华职业技术学院2015年在18家教育类中文核心期刊上共发表论文13篇，占公办高职院校发文总量的6.3%，发表论文数量连续五年位居全国高职院校第二。